酗酒是常见的造成精子畸形的原因之一。已有研究证实，酗酒产生的酒精中毒可能损伤精子，造成精子畸形率增高，同时还可造成性欲冷漠、阳痿、早泄等性功能异常。
吸烟者可使畸形精子发生率增高。每日抽烟越多，其畸形精子发生率越高，吸烟时间越长，畸形精子也越多。值得注意的是，吸烟的危害并不仅止于使畸形精子增多，还可以导致弱精症。
2.营养缺乏
与精子产生和成熟相关的微量元素锌、硒最为重要。当锌、硒缺乏时，下丘脑-垂体-性腺轴受到影响，使得垂体分泌促性腺激素下降，性腺功能减退，精子生成减少，从而导致精子的畸形率升高。
3.温度过高
睾丸产生精子，在附睾孕育成熟，它适合的温度是35～36℃，当各种原因导致阴囊部温度升高的时候，就会影响精子的发育。如长期穿紧身内衣，长期久坐(开车、骑车)，泡热水澡，高温环境工作等。
4.精索静脉曲张
精索静脉曲张影响精子发生，造成精子活动力下降，精子细胞形态上不成熟和尖头精子的数量增多。
5.感染
男子泌尿与生殖系统的某些感染，也是造成畸形精子症的重要原因之一。较常见的影响精子畸形的感染有前列腺炎、精囊炎、尿道炎、睾丸炎、附睾炎等。
